U skladu s različitim vrstama primijenjenog magnetskog polja, elektromagnetski mjerači protoka uglavnom imaju dvije vrste: istosmjerni i indukcijski.
Vanjsko konstantno magnetsko polje B istosmjernog elektromagnetskog mjerača protoka okomito je na os cijevi, a dvije elektroničke komponente instalirane su na C i D za mjerenje elektromotorne sile U koju inducira tekućina kada tekućina prelazi magnetsko polje. Brzina protoka Q može se dobiti sljedećom formulom:
Q=1/k*UA/Bd
U formuli, A je površina poprečnog presjeka cijevi; d je promjer cijevi; k je korekcijski koeficijent koji se koristi za ispravljanje utjecaja čimbenika koji se ne uzimaju u obzir pri izvođenju formule (poput činjenice da brzina protoka u cijevi mjerača protoka nije ujednačena). U normalnim mjeračima protoka k je oko 0,8, ali za elektromagnetske mjerače protoka specifičnih dimenzija i za određene radne uvjete koristi se metoda volumena (volumen koji teče kroz određeno vrijeme) za kalibriranje vrijednosti k.
Magnetsko polje može se generirati magnetom *koji je općenito izrađen od legure aluminija, nikla i dijamanta. Kad je protok velik, zbog većeg promjera cijevi, koristi se uzbudni namot sa jezgrom od željezne jezgre, a kroz njega se propušta konstantna istosmjerna struja za stvaranje približno jednoličnog magnetskog polja.
Indukcijski elektromagnetski mjerač protoka može se koristiti u slučaju da je temperatura izmjerene tekućine previsoka ili su elektroničke komponente jako korozivne. A i B su dva namota uzbude izmjeničnog napona s istim brojem zavoja (presjek je nacrtan na slici). Namoti su povezani serijski, ali su im trenutni smjerovi suprotni. Kad je tekućina u mirovanju, rezultirajući magnetski tok koji prolazi kroz indukcijsku zavojnicu C jednak je nuli, pa u zavojnici nema inducirane izmjenične elektromotorne sile. Kad tekućina teče, u indukcijskoj zavojnici stvara se izmjenična elektromotorna sila, čija je veličina proporcionalna brzini protoka. Na temelju ovog načela postoje mnoge izmjene, poput korištenja uzbudnog namota i postavljanja indukcijskog svitka u suprotnom smjeru s obje strane njegove simetrije te njihovog povezivanja u nizu. Kad tekućina teče, linije magnetske sile pomiču se u smjeru strujanja, uzrokujući indukciju s obje strane. Iznenađujuća elektromotorna sila u zavojnici nije nula, što neizravno može ukazati na veličinu protoka.
U cjevovodu elektromagnetskog mjerača protoka nema drugih dijelova, pa se osim za mjerenje protoka vodljivih fluida, može koristiti i za mjerenje protoka neprovodljivih tekućina različitih viskoznosti (u koje se dodaju tvari koje se lako ioniziraju) . Elektromagnetski mjerači protoka često se koriste u industriji nuklearne energije.